Фамилия Якубоглы образована от имени Якуб, которое является арабским вариантом имени Иаков. В переводе с древнееврейского оно означает «второй по рождению». Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.