Фамилия Якупов происходит от имени Якуп, которое является арабским вариантом древнееврейского имени Иаков. В переводе на русский язык оно означает «второй по рождению» или «идущий вслед, последователь». Однако имя Якуп (Якуб) было распространено также и в Польше, откуда эта форма имени Иаков проникла на Украину, в Белоруссию на Смоленщину. Поэтому нельзя исключать, что фамилия Якупов имеет славянское происхождение. Иаков - имя известного библейского героя, младшего из двух сыновей-близнецов Исаака и Ревекки. По преданию, Иаков выкупил у своего брата Исава право первородства за чечевичную похлёбку, а затем хитростью получил у Исаака благословение как первородный сын. Среди известных однофамильцев - Харис Абдрахманович Якупов (р. 1919), российский живописец, народный художник СССР.