Фамилия Ямина — одна из тех, где внешняя простота обманчива. На первый взгляд она кажется прозрачной: «яма», «ямочка». Но в действительности у неё как минимум два разных корня, и географически она рассыпана по всей России, что указывает на разные истории возникновения.

Самая распространённая версия — происхождение от мирского имени или прозвища Яма. В старину так могли назвать человека, жившего в низине, в овраге, «у ямы». Но чаще прозвище давали не по месту жительства, а по характеру или внешности: «ямой» в диалектах называли ворчуна, угрюмого человека, а также того, кто копает ямы — землекопа или могильщика. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ямины — дети или люди Ямы. Эта модель типична для русского севера и центральных областей.

Вторая версия — топонимическая. Фамилия могла закрепиться за выходцем из деревни с названием Ямино, Ямная или Яминка. Таких деревень множество в Вологодской, Костромской, Кировской и Нижегородской областях. В этом случае фамилия отвечала на вопрос «откуда?» и указывала на родовое гнездо. Переселенцы, переезжая в другие края, получали прозвание по покинутой деревне, и оно становилось наследственным.

Не стоит путать фамилию Ямина с созвучными фамилиями от слова «яма» в значении «ямочка на щеке» — такая модель (Ямочкин, Ямин) встречается, но крайне редко. Основная масса носителей фамилии Ямина ведёт род либо от прозвища, либо от названия селения.

Встречается и редкий вариант: фамилия могла образоваться от полной формы крестильного имени Иакинф (в просторечии Якинф, Якина) — через усечение и добавление суффикса. Но эта версия менее убедительна: переход «Якин» → «Ямин» нехарактерен для русской фонетики, и если такая трансформация и происходила, то лишь в единичных случаях на юге России.

Сословный состав носителей фамилии пёстрый: среди Яминых встречались и крестьяне-землепашцы, и церковнослужители, и мещане. В документах XVII–XVIII веков Ямины упоминаются в переписных книгах Вятской и Пермской губерний — там, где было много деревень с корнем «ям». В XIX веке фамилия встречается уже по всей европейской части России, но заметно чаще — в Поволжье и на Урале.

Однокоренные фамилии — Ямов, Ямкин, Ямочкин — имеют ту же основу, но разные суффиксы, что указывает на разные регионы и эпохи возникновения. Ямина — одна из самых старых в этой группе, поскольку суффикс -ин — один из древнейших в русских фамилиях.