Фамилия Ямолдина — женская форма, парная к мужской Ямолдин. Она образована с помощью типичного русского патронимического суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — «Ямолды» или «Ямолдина». Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Ямолда.

Корень здесь — тюркский. Слово «ямолда» можно разобрать на две части: «ям» (почтовая станция, ямская гоньба, система перевозок в Российской империи) и «олда» (вариант имени «Алда», «Алды» или тюркского слова со значением «старший», «вождь», «передний»). Таким образом, Ямолда — это человек, связанный с ямской службой: ямщик, содержатель почтовой станции или смотритель. В тюркских языках сложные имена с компонентом «ям» нередки: Ямгурчей (ям + гурчи — служитель), Ямса (ям + са — считающий, ведающий). Вторая часть «олда» могла быть и самостоятельным именем Алда, распространённым у татар и башкир. Вероятнее всего, прозвище Ямолда дали человеку, который либо служил на яму, либо был старшим среди ямщиков, либо получил имя по названию должности.

Фамилия редкая, и её география довольно узкая. Основной ареал — Урал и Зауралье, в частности Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. Это не случайно: именно в этих краях в XVI–XVIII веках активно развивалась ямская служба, связывавшая центр России с Сибирью и южными рубежами. Предки носителей фамилии Ямолдина скорее всего были татарами, башкирами или представителями других тюркских народов, принявшими православие и получившими фамилию по прозвищу.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных имён, фамилия Ямолдин сохранила исходное прозвище почти без изменений. Интересно, что в ней нет уменьшительно-ласкательного суффикса, который смягчил бы звучание: прозвище было прямым и функциональным, как и сама должность ямщика.