Фамилия Янгарцев — редкая и морфологически прозрачная. Её основа — «Янгар», за которой следует типичный русский патронимический суффикс -цев (вариант -ов после мягкого согласного). В отличие от фамилий на -ин, которые образуются от основ на -а/-я, суффикс -цев указывает на принадлежность к лицу по отцу: Янгарцев буквально значит «сын Янгаря».

Ключевой вопрос — что такое «Янгар». Самая вероятная версия: это диалектная или искажённая форма тюркского имени Янгир (Янгир, Енгир). В тюркских языках корень «ян(г)» означает «новый», а имя Янгир можно перевести как «новый муж», «новый герой» или «новый свет». Такие имена были распространены у башкир, татар, казахов и ногайцев. Попадая в русскую среду, имя Янгир могло адаптироваться в Янгар — через замену конечного -ир на более привычное -ар (ср. Булат — Булатар, Сабир — Сабар). Затем от прозвища Янгар (человек по имени Янгир) и возникла фамилия.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с топонимом. В Башкортостане есть село Янгарыш, а в Оренбуржье — речка Янгарка. Если предок был выходцем из местности с похожим названием, его могли прозвать Янгарским или Янгарцевым. Однако суффикс -цев чаще встречается в отчествах, чем в топонимических фамилиях, поэтому версия с личным именем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Янгарцев встречается точечно — в основном в Оренбургской области, на Южном Урале и в Татарстане. Это зона активных русско-тюркских контактов, где фамилии с основой на -гар/-гир не редкость (например, Янгиров, Янгаров). Носители Янгарцевых — скорее всего потомки русских крестьян или казаков, которые в XVIII–XIX веках восприняли тюркское имя от соседей или через крещение. Сословно фамилия не указывает на дворянство: суффикс -цев и отсутствие в боярских списках говорят о крестьянском или мещанском происхождении.

Словообразовательная модель проста, но редка: основа, оканчивающаяся на -арь (Янгарь), дала бы фамилию Янгарев, а форма Янгарцев подразумевает, что исходное прозвище или имя звучало как Янгарь (с мягким «р»). В русских говорах такое смягчение характерно для заимствований: ср. Булгарь → Булгарцев, Калмык → Калмыков, но Янгарь → Янгарцев. Это косвенно подтверждает, что имя пришло устным путём, через бытовое общение, а не через документы.