Фамилия Яничко — редкий случай, когда географию носителей можно определить почти точно по суффиксу. Окончание -ко указывает на украинское или белорусское происхождение: это типичная модель фамилий-прозвищ, распространённая на территории бывшей Речи Посполитой. В России такие фамилии встречаются редко, чаще всего в южных и западных областях, куда переселялись выходцы с Украины.

Основа фамилии — имя Ян. Это польская, западнославянская и западноукраинская форма канонического имени Иоанн (Иван). Суффикс -ич- в середине слова — показатель отчества или принадлежности: Яничко буквально означает «маленький Ян» или «сын Яна». Уменьшительно-ласкательный суффикс -к- (Янич-ко) мог закрепиться за младшим членом семьи или за человеком невысокого роста. В польской ономастике есть параллельная фамилия Janiczko — с тем же корнем и значением.

Версия о происхождении от прозвища «яныч» (от тюркского «янычар») маловероятна. Янычары — воины турецкой гвардии, и фамилия с таким корнем скорее имела бы форму Янычаров или Яныченко, а не Яничко. Славянская основа «Ян» даёт более естественную словообразовательную цепочку.

Социальный состав носителей фамилии неоднороден. В XIX веке Яничко фиксировались и среди крестьян Волынской губернии, и среди мещан Подолья. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках нет — это фамилия простонародная, образованная от имени, а не от названия поместья или должности. Сегодня Яничко встречается в основном в западных областях Украины, в Беларуси и среди потомков эмигрантов в Польше.