Фамилия Яниша — редкий пример, когда фамилия образована не от полной, а от краткой формы имени. В её основе лежит имя Ян — западнославянская и прибалтийская форма канонического имени Иоанн (в русской традиции — Иван). Но ключевую роль здесь играет суффикс -иша.

В славянской ономастике суффикс -иша (-iša) выполняет особую функцию. Он характерен для чешского, словацкого и польского языков, где образует уменьшительно-ласкательные или фамильярные формы имён: Яниша — ласковое обращение к Яну (что-то вроде «Янечка» или «Янушка»). В русских фамилиях такой суффикс почти не встречается, поэтому фамилия Яниша — маркер западного происхождения.

Скорее всего, фамилия закрепилась в тех регионах, где исторически жили поляки, чехи, словаки или украинцы под влиянием польской культуры (Западная Украина, Беларусь, юг Литвы). В русской среде фамилия могла появиться в результате миграции или через представителей шляхты, попавших в состав Российской империи.

Грамматически фамилия стоит в форме именительного падежа единственного числа и не склоняется как типичная русская фамилия на -а (в отличие от, скажем, фамилий на -ин). Это дополнительно указывает на её неславянское в узком смысле происхождение — в польском и чешском языках фамилии на -иша склоняются иначе.

Что касается значения: предок носителя фамилии был, скорее всего, просто Яном, которого в быту называли уменьшительно Яниша. Никакого ремесла или прозвища за этим не стоит — чистая патронимия, но оформленная нестандартным для русского уха способом. Встречается ли фамилия в дворянских родословных или в крестьянской среде — сказать сложно из-за её редкости, но по модели образования она не указывает на сословие.