Фамилия Янишин — классический пример того, как географический маркер превратился в родовое имя. Её основа — не имя и не прозвище, а название населённого пункта. Корень «Яниш-» восходит к топонимам вроде Янишево, Янишки или Янишин, которых немало на западе Украины, в Беларуси и Польше. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — янишин, то есть выходец из Янишева или человек, владеющий землёй в этой местности. Такая модель образования типична для фамилий, которые закрепились за крестьянами и мещанами после отмены крепостного права, когда людям массово давали фамилии по месту жительства.

Интересная деталь: в польской и украинской ономастике встречается параллельная форма Янишевский, где суффикс «-ский» указывает на шляхетское происхождение и владение имением. Янишин же — вариант более демократичный, без сословного оттенка. Он мог возникнуть и на русском северо-западе, где суффикс «-ин» в фамилиях преобладает, и в среде украинских крестьян, где топонимические фамилии часто усекали до простой формы.

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с личным именем Ян (польская и западноукраинская форма от Иван). Тогда Янишин — «сын Яниша» (Яниш — уменьшительное от Ян). Но против этого говорит редкость такой модели в славянских языках: обычно от имени Ян образуют Янович или Яновский, а не Янишин. Топонимическое происхождение надёжнее.

Встречаемость фамилии сегодня — сплошной ареал от Львовской области до Брянщины, с отдельными гнёздами в Беларуси. Носители Янишина в XIX веке — чаще всего крестьяне и однодворцы, реже мещане. Дворянских родов с такой фамилией в российских родословных книгах нет, что тоже подтверждает её «низовое» происхождение.