Фамилия Янкилов — относительно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней слышится что-то нерусское, и это верное чутьё: основа фамилии — не славянская, а тюркская или, что вероятнее, еврейская.

Разбираем словообразовательную модель. Суффикс -ов указывает на русскую патронимическую форму: «чей?» — Янкилов, то есть потомок человека по имени или прозвищу Янкил. Само имя Янкил — это, скорее всего, адаптированный на русской почве вариант еврейского имени Янкель (уменьшительное от Яков, в идише — Yankl). В среде ашкеназских евреев, особенно на территории черты оседлости (Украина, Белоруссия, Польша), фамилии на -ов, -ин образовывались от имён по той же модели, что и у русских: Янкель → Янкилов. Массово такие фамилии закреплялись в Российской империи в конце XVIII — XIX веке, когда еврейское население обязали иметь постоянные фамилии.

Есть и вторая, менее вероятная версия — тюркская. В некоторых тюркских языках существует корень «янк» или «йанк» со значением «бок», «сторона», а также личное имя Янкыл. Однако для фамилии Янкилов эта гипотеза слабая: в тюркских фамилиях на -ов чаще встречаются основы вроде Янбаев, Янчурин, а форма Янкил почти не фиксируется в ономастических источниках по тюркским народам. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — еврейская, с основой Янкель.

Интересная деталь: фамилия Янкилов могла возникнуть и в среде крещёных евреев, которые нередко получали фамилии по имени отца, записанному уже в русской огласовке. Географически фамилия встречается в западных областях России и на Украине, что подтверждает её связь с регионом бытования еврейских фамилий. Таким образом, предки носителей фамилии Янкилов, скорее всего, были еврейскими ремесленниками, торговцами или мещанами, а сама фамилия — простое указание на отчество: сын Янкеля.