Фамилия Яныбекова — женская форма фамилии Яныбеков, и её разбор стоит начать с мужского варианта, потому что именно в нём скрыта ключевая загадка. Основа фамилии — составное имя или прозвище «Яныбек». Первая часть, «Яны», скорее всего, восходит к тюркскому корню «яны» (в разных диалектах — «новый», «свежий» или «душа»). Вторая часть, «бек», — это широко распространённый у тюркских народов титул, обозначающий князя, господина или предводителя. Соединяясь, эти части дают значение вроде «новый господин» или «свежий (молодой) бек». Впрочем, есть и другая версия: «Яны» могло быть личным именем, сокращением от более длинных имён вроде Яныш или Янгур, и тогда «Яныбек» — это просто «бек по имени Яны».

Суффикс «-ов» в фамилии Яныбеков указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии от тюркских основ в XV–XVIII веках, когда служилые люди или крестьяне из татарских, башкирских, казахских и других тюркских родов попадали в состав Российского государства. Фамилия буквально означает «потомок Яныбека» или «принадлежащий Яныбеку». Интересно, что в самой тюркской среде фамилии с суффиксом «-ов» нехарактерны — там чаще встречаются патронимы на «-улы» или «-кызы». Значит, предки носителей фамилии Яныбекова в какой-то момент прошли через русское делопроизводство: перепись, рекрутский набор или запись в метрическую книгу.

Географически фамилия Яныбекова встречается в Поволжье и на Южном Урале, особенно среди татар и башкир, но также фиксируется у казахов и ногайцев. В дореволюционных записях её можно найти в Оренбургской, Уфимской и Казанской губерниях. Сословно носители могли быть как государственными крестьянами, так и представителями служилого татарского дворянства — «бек» в основе намекает на возможное знатное происхождение, но за века этот титул мог стать просто частью имени, утратив социальный вес.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Янышев, Яныгин, Янбеков — показывает, что «Яныбек» стоит особняком: двойная основа с титулом встречается реже, чем простые прозвища. Это делает фамилию ценной для историка: она сохранила архаичную форму, где личное имя и титул слились в одно слово ещё до попадания в русскую документацию.