Фамилия Яныбеков — яркий пример тюркского имени-основы, адаптированного русской патронимической моделью. Её разбор стоит начать с суффикса -ов: он указывает на принадлежность («чей?») и типичен для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ, оканчивающихся на согласный. Ядро фамилии — личное имя Яныбек.

Имя Яныбек составное, тюркского происхождения. Первая часть, «Яны», восходит к тюркскому «jan» (душа, близкий). В казахском, татарском и башкирском языках это слово входит в состав многих имён и означает «душа», «любимый». Вторая часть, «бек», — широко распространённый титул, означающий «князь», «господин», «правитель». В составе имени он указывает на высокое положение или пожелание власти. Таким образом, Яныбек можно перевести как «душа-бек», «любимый господин» или «близкий правитель».

Словообразовательная модель типична для фамилий, возникших в среде тюркских народов, вошедших в состав Российской империи. Фамилию Яныбеков вряд ли носили русские дворяне; её носители — потомки выходцев из тюркской среды (татары, башкиры, казахи, ногайцы), которые при получении русских фамилий в XIX веке зафиксировали имя отца в форме притяжательного прилагательного. Географически фамилия тяготеет к Поволжью (Татарстан, Башкортостан), Оренбуржью и Казахстану.

Споров вокруг этимологии почти нет: основа прозрачна для тюркских языков. Редкая деталь — возможное чередование «Яны» с «Джаны» (как в имени Джанбек). В русской записи звук «дж» часто передавался как «я» или «ж», поэтому Яныбеков и Жаныбеков — варианты одной фамилии, различающиеся диалектным произношением. Социально предки носителя фамилии скорее всего относились к служилым татарам или башкирам, либо к крестьянам, принявшим фамилию по имени отца при переписях. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» нет.