Фамилия Ящишина — женская форма, образованная от мужской Ящишин. В основе лежит суффикс -ин, который в русской, украинской и белорусской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — Ящишин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Ящиша. Реже встречается модель с суффиксом -ишин, где -иш- может быть увеличительным или пренебрежительным оттенком. Но в данном случае корень явно связан со словом «ящик».

Самая прямая версия происхождения — прозвище Ящиша, то есть человек, связанный с изготовлением, продажей или переноской ящиков: плотник, столяр, коробейник или торговец. В говорах «ящиша» могли назвать и того, кто постоянно носил с собой сундук или короб, например, бродячего ремесленника. Менее вероятно, но возможно, что прозвище дали за плотное телосложение — «как ящик».

Географически фамилия редкая. Основной ареал — западные области Украины (Волынь, Ровенщина, Хмельнитчина) и юго-запад Беларуси (Брестчина). В России встречается единично, чаще в результате миграций. Суффикс -ишин характерен для украинской модели фамилий на -ишин/-ишын, где основа — личное имя или прозвище с уменьшительно-уничижительным суффиксом -иш-.

В отличие от более частых фамилий типа Ящиков (от профессии) или Ящин (от имени Яков в диалектной форме), Ящишина сохранила редкую словообразовательную цепочку: ящик → Ящиша (прозвище) → Ящишин (сын Ящиши). В польских записях XVIII–XIX веков встречается форма Jaszczyszyn, что указывает на возможное смешение с корнем «ящер» (ящерица), но для Ящишина такое сближение спорно — фонетически «ящ» и «ящер» различаются.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или ремесленным. Фамилия не относится к дворянским и не фиксируется в родословных книгах Российской империи. В современных базах данных носителей немного, что делает её ценной для генеалогического поиска — она не размыта массовым распространением.