Фамилия Яшукин — редкий случай, когда основа очевидна, а суффикс заставляет задуматься. В её основе лежит имя Яша — народная, обиходная форма канонического имени Иаков (в русской традиции — Яков). Казалось бы, перед нами типичная «патронимическая» фамилия: Яша плюс суффикс принадлежности. Но здесь не -ов и не -ин, а -укин.

Суффикс -ук- (с последующим -ин) в русских фамилиях — явление западнорусское, характерное для территорий, где исторически сильны украинские и белорусские говоры. Если бы фамилия образовалась в центральной России, мы бы получили Яшков (от Яшко) или Яшин. Яшукин же выдаёт в предке носителя юго-западного диалекта: там уменьшительная форма имени звучала как Яшук (Яшука). Соответственно, Яшукин буквально означает «сын Яшука», то есть внук или потомок человека по имени Яков.

Вторая, менее очевидная, версия связывает фамилию не с именем, а с прозвищем. В некоторых говорах «яшук» могли называть человека с характерной манерой речи — якающего, то есть говорящего с особым ударением на «я». Однако это объяснение уступает первому: антропонимическая модель «имя + -ук» настолько продуктивна, что видеть здесь прозвище нет оснований.

Географически фамилия Яшукин тяготеет к Курской, Белгородской и Воронежской областям, а также к востоку Украины — именно в этих краях фамилии на -укин встречаются чаще, чем где-либо ещё. Сословно предки Яшукиных, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — государственными землепашцами, жившими на южных рубежах Московского государства. В дворянские родословные книги эта фамилия, насколько можно судить, не попала, что тоже косвенно подтверждает её «простое» происхождение.

Таким образом, Яшукин — фамилия, которая говорит о южнорусских корнях рода и о том, что в основе её лежит имя Яков, но не в столичной, а в диалектной, более архаичной форме.