Фамилия Яшунин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Яшунин послужило церковное имя Иаков. Мужское крестильное имя Иаков переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Основой же при образовании фамилии послужила его просторечная форма — Яшуня (Иаков < Яков < Яша < Яшуня). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Яшуня, со временем получил фамилию Яшунин. О точном месте и времени возникновения фамилии Яшунин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Яшунин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.