Фамилия Юхананова — женская форма, указывающая на принадлежность к роду Юханановых. В основе лежит мужское имя или прозвище Юханан, которое восходит к библейскому имени Иоанн (в древнееврейской форме Йоханан — «Яхве смилостивился»). В русской традиции имя Иван стало самым распространённым, но в северных и восточных говорах, а также под влиянием финно-угорских языков, прижились варианты вроде Юхан, Юхана. В карельском, вепсском и коми языках имя Иван звучит как Юхан, Юван или Иван — отсюда и фамилии Юханов, Юханцев, Юхананов.

Суффикс -анов указывает на отчество, образованное от имени Юханан через притяжательную форму: «чей сын?» — Юхананов. Такая модель характерна для фамилий, возникших в XVI–XVII веках на Русском Севере, особенно в Архангельской, Вологодской и Олонецкой губерниях. Там крестьяне и посадские люди часто получали фамилии по имени отца, причём в документах фиксировалось полное имя, включая уменьшительные и диалектные формы.

Интересно, что фамилия Юхананова — редкая даже по северным меркам. Встречается в основном в Карелии и Мурманской области, что подтверждает её привязку к региону, где пересекались русские, карелы и саамы. Предок носителя фамилии мог быть крестьянином или рыбаком, но само имя Юханан не указывает на занятие — только на то, что его отца звали Юханом, то есть Иваном по-местному.

В отличие от фамилий с суффиксом -ин (Юханин) или -ов (Юханов), форма на -анов подчёркивает, что имя-основа было полным, а не сокращённым. Поэтому Юханановы — это «дети Юханана», а не «Юхи» или «Юханки», что делает фамилию более архаичной и книжной по происхождению.