Фамилия Юйкова — женская форма фамилии Юйков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный: Юйко → Юйков. Но здесь есть тонкость: основа «Юйк-» не характерна для славянских имён или прозвищ, что сразу заставляет искать другие корни.

Скорее всего, фамилия Юйков — русифицированная форма тюркской или финно-угорской фамилии. В татарском, башкирском, чувашском языках есть личное имя Юй (или Йый), которое могло означать «собирающий», «объединяющий», либо восходить к древнему родовому прозвищу. В северных диалектах коми и удмуртов встречается слово «юй» — «река» или «вода», что могло стать основой для прозвища человека, живущего у воды. Суффикс -ов в таком случае — чисто русский, добавленный при адаптации фамилии в русскоязычной среде.

Версия о происхождении от русского имени Юрий (в просторечии Юра, Юрка, а затем Юйка) маловероятна: переход «р» в «й» не характерен для русских говоров, а уменьшительная форма «Юйка» нигде не зафиксирована. Также не стоит связывать фамилию с «юй» как звукоподражанием — это натяжка.

Географически фамилия Юйков встречается в Поволжье, особенно в Татарстане, Башкортостане и Удмуртии, что подтверждает её тюркское или финно-угорское происхождение. Встречается она редко, что говорит о локальном бытовании: носители — потомки крещёных татар или удмуртов, получивших фамилию по имени предка.

Таким образом, носительница фамилии Юйкова с высокой вероятностью наследует прозвище или имя предка из тюркской или финно-угорской среды, которое позднее оформилось по русской модели.