Фамилия Забабонин — один из тех случаев, когда прозвище, лёгшее в основу, звучит почти как загадка. Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Забабонин — сын или потомок человека по прозвищу Забабона. Сама основа «забабон» в русских говорах имеет несколько значений, и все они связаны с народной культурой.

Корень «баб(а)» здесь не столько о женщине, сколько о магии и суевериях. В диалектах «забабоны» — это заговоры, заклинания, колдовские действия, а также пустые, вздорные разговоры. Человека, который знался с ворожеями, лечил заговорами или просто любил говорить загадочно и туманно, могли прозвать Забабоной. Вторая версия, менее распространённая, возводит прозвище к глаголу «забабонить» — начать болтать вздор, молоть чепуху. В этом случае Забабона — болтун или пустомеля.

Географически фамилия редкая и тяготеет к северным и центральным областям России, где диалектная лексика с корнем «баб» в значении «колдовство» была особенно живуча. Встретить Забабониных можно в Вологодской, Костромской и Кировской областях, а также в Поволжье. Сравнение с однокоренными фамилиями — Забабурин, Забабкин — подтверждает, что прозвища с этим корнем образовывались по одной модели, но с разными суффиксами.

Сословной привязки у фамилии нет: Забабонины могли быть и крестьянами, и мещанами. Прозвище не несло оскорбительного оттенка, скорее указывало на характерную черту — связь с народной медициной или склонность к загадочным речам. В крестьянской среде, где к знахарям относились настороженно, такое прозвище могло закрепиться за конкретной семьёй.