Фамилия Заглиев — редкая, с двумя основными географическими центрами: Кавказ и Казахстан. И в том, и в другом случае в основе фамилии лежит прозвище Загли, которое, скорее всего, указывало на место жительства предка.

На Кавказе корни фамилии, вероятнее всего, ведут к названию реки Загли, протекающей в Азербайджане. Человек, живший на её берегу, получал прозвище по гидрониму — Загли. От него и пошла фамилия Заглиев. Такая модель образования (от названия реки или местности) типична для многих народов Кавказа, где географические ориентиры часто становились родовыми именами.

Казахский вариант фамилии имеет другую топонимическую основу. По одной из версий, предок казахских Заглиевых мог жить у бухты Загли на Байкале. Хотя Байкал находится далеко от традиционных казахских земель, это не исключает возможности миграций или временного проживания отдельных родов в тех краях. Прозвище Загли в этом случае также закрепилось за родоначальником, а затем перешло в фамилию.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на согласный или гласный «и». В данном случае суффикс добавили к прозвищу Загли, получив «Заглиев» — буквально «сын (или потомок) Загли». Это указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русскоязычной среде или под влиянием русской делопроизводственной традиции.

Таким образом, носители фамилии Заглиев, скорее всего, происходят из разных родов, объединённых лишь схожей моделью именования по месту жительства: одни — с кавказской реки, другие — с байкальской бухты.