Фамилия Зайналабидов происходит от личного имени Зайналабид, которое особенно распространено на Кавказе и в Закавказье. Это имя составное, арабского происхождения. Первая часть — «зайнель» — означает «украшение», вторая — «габид» — переводится как «совершающий богослужение», «поклоняющийся», «раб Божий». Вместе имя Зайналабид осмысляется как «один из лучших служителей», то есть тот, кто украшает собой служителей.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе имени добавили суффикс -ов. Такой способ словообразования типичен для фамилий, которые давали по отцу: Зайналабидов буквально означает «сын Зайналабида». Со временем фамилия закрепилась за потомками человека с таким именем.

По документам Республики Дагестан известны носители этой фамилии начала XX века. В поселке Дагестан, Ауховском районе, в ауле Бонай проживали Зайналабидов Умар (родился в 1913 году) и Зайналабидова Паху (родилась в 1895 году). В селе Дылым Казбековского района отмечен Зайналабидов Зайналабид, родившийся в 1910 году. Эти записи показывают, что фамилия уже тогда была устоявшейся и передавалась по наследству, а имя Зайналабид продолжало бытовать внутри семьи.

С точки зрения словообразования фамилия редкая: она сохраняет полную форму исходного арабского имени без усечения или сокращения, что отличает её от более привычных русских фамилий на -ов, образованных от коротких обиходных имён.