Фамилия Зайнутова образована от диалектного варианта мужского мусульманского имени Зайнулла — Зайнут. Как и большинство имен восточного происхождения, имя Зайнулла имеет сложную основу. Первая часть этого имени восходит к древнетюркскому слову «зайн», которое в переводе на русский язык означает «украшение, узор». Таким образом, один из вариантов перевода этого имени звучит как «украшение Аллаха». Существуют и другие диалектальные варианты этого имени: Зайнул, Зайни, Зайнаш, Зайнак, Зайнук, Зайнак, Зайнал. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Зайнутовых можно лишь на основании генеалогических исследований.