Фамилия Зелепущенкова — женская форма от Зелепущенков, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт географию. Суффикс -енков (вариант -онков) — типично южнорусский, особенно для Курской, Орловской, Воронежской, Тамбовской областей и восточной Украины. В северных и центральных регионах России предпочитали -ов/-ев, а на юге — уменьшительно-ласкательный -енко, который потом оформился в фамилию через -ов. То есть Зелепущенков — это «чей?» — потомок человека по прозвищу Зелепущенко.

Сама основа — Зелепущенк(о) — восходит к прозвищу Зелепущ(а) или Зелепущеня. Корень здесь «зеле-», который в русских говорах связан с зеленью, незрелостью, молодостью. Сравните: «зеленый» в значении «молодой, неопытный», диалектное «зелепупый» — недозрелый, зеленый плод. Вторая часть — «-пущ-» — может быть искажением от «пуп» или «пузо». В народной этимологии так могли называть человека с зеленоватым животом (например, от болезни или питания травой), но правдоподобнее другое: прозвище Зелепуп — для молодого, неопытного парня, «зеленого пупа», то есть подростка. Суффикс -енк- затем добавил значение «сын Зелепупа» или «маленький Зелепуп».

Таким образом, Зелепущенков — это «внук Зелепущенко», где Зелепущенко — сын или ученик Зелепупа. Предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином или ремесленником из южнорусских или украинских земель, и прозвище ему дали по молодости или незрелости — либо в прямом смысле (зеленый плод), либо переносном (неопытный юнец). Встречаются также версии, связывающие фамилию с диалектным «зелепуха» — трава или каша из зелени, но это менее вероятно: суффикс -ущ- в прозвище указывает на действующее лицо, а не на предмет.

Фамилия редкая, и её носители в основном сосредоточены в Курской, Белгородской областях и в сопредельных районах Украины — Харьковской, Сумской. В документах XIX века Зелепущенковы числятся среди государственных крестьян. Написание с двумя «е» (Зелепущенков, а не Зелипущенков) сохраняет связь с цветом, а не с именем Зелий.