Оно восходит к древнеславянскому корню «зем-» со значением «низ». Вероятно, прозвище либо содержало указание на внешность основателя фамилии (невысокий рост), либо отражало особенности места жительства предка (в низине). Возможно также, что в основе прозвища Зёма лежит чешское слово «zemĕ» – «земля». Так в Чехии называли фермера или человека, владевшего небольшим участком земли. Таким образом, прозвище Зёма указывает и на род занятий и на социальное положение предка. Согласно еще одной гипотезе, фамилия Зёма образована от тюркского женского имени Земфира, которое в переводе с арабского означает «непокорная». В основу фамилии лег диалектный вариант имен — Зёма.