Фамилия Зейкан имеет прозвищное происхождение и напрямую связана с украинским нарицательным «зейка», что означает «ротозей». Так могли назвать человека невнимательного, рассеянного, неуклюжего или, напротив, слишком любопытного, который постоянно лез не в свои дела. Прозвище указывало на яркую черту характера родоначальника фамилии — его неосторожность или назойливое любопытство.

Словообразовательная модель здесь проста: к основе «зейк-» добавили суффикс «-ан». В украинской и южнорусской ономастике этот суффикс часто встречается в прозвищах, образованных от прилагательных или существительных, и придаёт слову оттенок характерности или увеличительности. То есть Зейкан — это буквально «тот, кто является ротозеем», «большой зейка». Такая модель типична для прозвищ, которые закреплялись как фамилии без дополнительных родовых окончаний (-ов, -ин, -ский), что указывает на позднее оформление фамилии в среде украинского или белорусского крестьянства.

Географически фамилия Зейкан встречается прежде всего на западе и в центре Украины, а также в приграничных районах Беларуси и Польши. Встречаемость её невысока, что говорит о локальном, возможно, даже односельском происхождении: прозвище могло закрепиться за одной семьёй в конкретном селе и не распространиться широко.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Зейка, Зейко, Зейкин — показывает, что форма Зейкан самая редкая. Если Зейко и Зейкин образованы по стандартным восточнославянским моделям, то суффикс «-ан» выбивается из ряда, что делает фамилию особенно ценной для этимологов: она сохранила архаичную или диалектную словообразовательную норму. Возможно, в говоре той местности, где возникла фамилия, слово «зейка» имело не только значение «ротозей», но и дополнительные смысловые оттенки — например, «зевака», «глазеющий».