Фамилия Зейналян — армянская, и её разумнее всего разбирать, отталкиваясь от суффикса и географии. Суффикс «-ян» — один из самых распространённых в армянской ономастике; он указывает на принадлежность или происхождение, примерно как русское «-ов/-ев». В дословном переводе Зейналян — «из рода Зейнала» или «потомок Зейнала».

Основа фамилии — мужское личное имя Зейнал. Это имя арабского происхождения, распространённое у народов, испытавших влияние ислама, в том числе у армян. Корень «зейн» (زين) по-арабски означает «красота», «украшение», «великолепие». Полное имя Зейнал-Абидин (زين العابدين) переводится как «краса верующих» или «украшение поклоняющихся», но в бытовом употреблении оно часто сокращалось до Зейнал. Таким образом, фамилия Зейналян буквально значит «принадлежащий к роду Красавца» или «из потомков Украшения» — речь идёт не о внешности, а о высоком качестве, достоинстве.

В армянской среде фамилии на «-ян» часто образовывались от имён, которые несли религиозный или почётный оттенок. Зейналян — не исключение. Носители этой фамилии — потомки человека по имени Зейнал, который, скорее всего, жил в восточных регионах исторической Армении, где было сильно влияние персидской и арабской культуры: в Карабахе, Зангезуре или Нахичевани. В Западной Армении (на территории современной Турции) такие имена встречались реже.

В отличие от русских фамилий, где суффикс мог указывать на сословие (крестьяне — «-ов», духовенство — «-ский»), армянский «-ян» универсален. Он не говорит о знатности или бедности предка. Однако само имя Зейнал — не крестьянское прозвище, а книжное, связанное с исламской традицией. Это наводит на мысль, что родоначальник мог быть грамотным человеком, возможно, священнослужителем или торговцем, поддерживавшим связи с мусульманским миром.

С точки зрения словообразования, фамилия прозрачна: корень «зейн» и суффикс «-ал» (уменьшительная или адаптирующая форма в тюркских и арабских заимствованиях) плюс армянский патронимический «-ян». Никаких редких или спорных элементов в ней нет.

Споров о происхождении фамилии практически не возникает. Единственная альтернативная версия — связь с тюркским «зейнал» (вариант того же арабского имени), но это не меняет сути: основа всё та же. В армянской среде такие фамилии — свидетельство многовекового культурного обмена, когда христианский народ усваивал арабские имена, переосмысляя их в рамках собственной традиции.