Фамилия Зезюля — один из тех случаев, когда в основе лежит не имя, не профессия, а прозвище, данное по поведению или характерной черте. Её южнорусское и украинское происхождение выдают и звучание, и суффикс. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от имён и прозвищ с помощью притяжательного суффикса, Зезюля — это «окаменевшая» исходная форма прозвища, оставшаяся без патронимического суффикса. Такая модель типична для украинской ономастики и для западнорусских земель, где фамилии часто закреплялись в чистом виде, без переделки на великорусский манер.

Корень фамилии — диалектное слово «зезюля». В южных и западных говорах русского языка, а также в украинском языке так называют кукушку. Прозвище Зезюля могли дать человеку по нескольким причинам. Самая прямая — за привычку часто и громко аукаться или перекликаться, подобно кукушке. Но есть и другая, более тёмная версия. В народной традиции кукушка — птица-вещунья, символ одиночества и вдовства. Прозвище могли закрепить за нелюдимым, замкнутым человеком или, наоборот, за тем, кто любил «куковать» — скитаться, не имея своего дома. В некоторых говорах «зезюлей» называли и женщину лёгкого поведения, но для мужской фамилии эта версия маловероятна.

Словообразовательная модель показывает, что перед нами не адаптированная, а «живая» форма. Если бы носитель фамилии перебрался в центральные или северные губернии России, его прозвище почти наверняка превратили бы в Зезюлин (по модели «чей?» — «Зезюлин сын»). Сохранение формы Зезюля указывает на то, что фамилия сложилась и закрепилась именно на территории современной Украины или в южных областях России (Курская, Белгородская, Воронежская области), где суффиксальная переработка прозвищ была необязательной.

В ономастическом контексте фамилия Зезюля стоит в одном ряду с такими же «птичьими» прозвищами, как Сорока, Воробей, Голубь, Соловей. Но если Сорока или Воробей — фамилии, распространённые повсеместно, то Зезюля — маркер диалектной зоны. Она сразу указывает на южное происхождение рода, где кукушку называли именно «зезюлей», а не «кукушкой» или «кукувицей».

Социальный статус первых носителей фамилии был, скорее всего, крестьянским или казачьим. В среде дворянства и духовенства такие «простые» прозвищные фамилии встречаются редко — там преобладали фамилии на -ский или образованные от церковных имён. Зезюля — фамилия из народной гущи, отражающая живой язык и бытовую наблюдательность тех, кто давал прозвища.