Основой фамилии Жаболенко послужило мирское имя Жабол. В основе мирского имени Жабол лежит нарицательное «жаба». Это были притяжательные прилагательные с суффиксами –о/-е, изначально указывающие на имя главы семейства. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Жабол, со временем получил фамилию Жаболенко.