Фамилия Жакажанов — редкий пример, когда в основе лежит удвоение корня, и разобрать её можно только через тюркские языки. Если отбросить русский фамильный суффикс -ов, остаётся основа Жакажан. Она состоит из двух частей: «жака» и «жан». В казахском, татарском и других тюркских языках слово «жан» (вариант — «ян») означает «душа», «человек», «близкий». Это один из самых популярных компонентов в личных именах (Жанболат, Жангельды, Айжан). Первая часть — «жака» — может восходить к слову со значением «воротник», «край», «берег» (в переносном смысле — «опора», «защита»). Таким образом, имя Жакажан, от которого пошла фамилия, можно прочитать как «душа-опора» или «защитник души» — типичное для тюркской ономастики имя-пожелание, которое давали ребёнку в надежде, что он станет надёжным человеком.

Интересно, что фамилия образована не по самой распространённой модели. Обычно тюркские имена на -жан давали фамилии с суффиксом -ов напрямую: Жанов, Жаналиев, Жангельдинов. Здесь же мы видим полное удвоение корня — Жакажан + -ов. Это говорит о том, что имя Жакажан бытовало как самостоятельное двусоставное имя, а не как вариация на тему «жан». В казахском именослове действительно встречается мужское имя Жакажан, хотя и не самое частое. Фамилия, скорее всего, сформировалась у казахов или у тюркских народов, живущих в смешанных регионах (например, в Оренбуржье, Астраханской области, Казахстане), где в XIX — начале XX века при переписях и паспортизации фиксировали полную форму отчества или имени отца.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна тем, что в русской записи сохранила внутреннее удвоение, которое в устной речи могло редуцироваться. Если бы имя сократили до Жакан, фамилия звучала бы как Жаканов — и таких фамилий гораздо больше. Форма Жакажанов указывает на то, что носитель или его предок носил именно полное имя, и при оформлении документов чиновник не стал его урезать. Это редкий случай, когда письменная фиксация сохранила архаичную структуру имени.

По сословной принадлежности предки Жакажановых, скорее всего, были кочевниками-скотоводами или крестьянами из тюркской среды, так как фамилии на -ов у казахов, башкир и татар получали в основном простые люди, а не знать (у последней были фамилии на -ин, -ский или родовые имена). Никаких сведений о дворянстве или известных исторических личностях с этой фамилией нет — это не делает её менее ценной, просто указывает на народное, бытовое происхождение.