Фамилия Жакышова — редкий пример, где основа, скорее всего, тюркская, а суффикс — русский, что указывает на позднее оформление фамилии по русской модели. Суффикс -ов- (в женском роде -ова) типичен для русских фамилий, образованных от имен или прозвищ на согласный. Однако корень «Жакыш» явно не славянский. С большой вероятностью, это фонетический вариант тюркского имени Жакып, которое восходит к библейскому Иакову (Якубу). В казахском, киргизском и других тюркских языках имя «Жакып» распространено, а форма «Жакыш» могла появиться как местный диалектный вариант или результат упрощения произношения. Таким образом, фамилия Жакышова буквально означает «потомок (или жена) Жакыша».

Географически фамилия тяготеет к регионам с тюркским населением, особенно к Казахстану и прилегающим территориям России. Встречаемость её крайне низкая, что говорит о локальном происхождении — возможно, от прозвища конкретного человека в одном ауле или селе. Альтернативная, менее вероятная версия: основа «Жакыш» могла быть прозвищем, данным по внешности или характеру, но для такой гипотезы нет устойчивых семантических параллелей в известных словарях тюркских прозвищ.

Интересная деталь: в русской традиции фамилии на -ов от тюркских основ часто фиксировали не родовое имя, а имя отца или деда, который первым получил документы на русском языке. То есть первый носитель фамилии (Жакыш) мог жить в XIX — начале XX века, когда шёл массовый учёт населения. Фамилия не получила широкого распространения, поэтому её носители, скорее всего, связаны общим предком в пределах нескольких поколений.