Фамилия Жакимова — женская форма мужской фамилии Жакимов. В основе лежит личное имя Жаким — один из вариантов имени Аким, которое, в свою очередь, восходит к древнееврейскому Иоаким («Яхве воздвиг»). Такая замена начального «А» на «Ж» — не случайность, а характерная черта тюркских языков, где звук «а» в начале слова часто переходит в «ж» или «й». Поэтому фамилия Жакимов — это классический пример обрусевшей тюркской фамилии, образованной от крестильного имени.

Морфологически фамилия проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Жакимов — сын Жакима. Модель типична для русских фамилий, но с нехарактерным для славянских языков корнем. Встречается фамилия преимущественно в регионах с сильным татарским, башкирским или казахским влиянием — в Поволжье, на Урале, в Западной Сибири. В Казахстане и Средней Азии имя Жаким и производные от него фамилии тоже распространены, но там они часто оформляются без русского суффикса, например, просто Жакимов или Жакимулы.

Однокоренные фамилии — Акимов, Екимов, Якимов. Но Жакимов стоит особняком: если Акимовы и Якимовы — это вариации одного и того же имени, закрепившиеся в русской среде, то Жакимов выдает тюркский след. Предки носителя фамилии, скорее всего, были крещеными татарами, башкирами или представителями других тюркских народов, принявшими православие, но сохранившими в быту привычный фонетический облик имени.

Встречается и альтернативное объяснение: в некоторых тюркских языках «жаким» или «жақым» означает «сторона», «бок» или «приятный». Однако это редкая версия, и она не выдерживает проверки массовым материалом: подавляющее большинство носителей фамилии Жакимов ведут родословную от людей, носивших имя Жаким, а не прозвище, связанное с географическим термином.