Фамилия Жанкеев — редкий пример, где тюркская основа встретилась с русским патронимическим суффиксом, но не самым привычным образом. Если бы фамилию образовали по стандартной модели, мы бы увидели «Жанкеев» от имени Жанкей (тюркское «жан» — душа, человек, плюс уменьшительный аффикс «-кей»). Однако здесь работает другой механизм: суффикс «-ев» присоединился к основе, которая сама по себе уже содержит русский фамильный формант «-еев». Проще говоря, исходная фамилия могла звучать как Жанкеев, а затем в ходе переписи или бытового употребления к ней добавили ещё один слой — «-ев», что дало двойное оформление. Такое встречается у фамилий, которые долго бытовали в устной традиции без письменной фиксации, или при адаптации нерусского имени к русской системе.

Основа «Жанкей» восходит к казахскому или башкирскому имени, где «жан» — душа, жизнь, а «кей» — уменьшительно-ласкательный суффикс. Получается что-то вроде «душенька», «милый человек». В тюркской ономастике такие имена давали как пожелание долгой жизни или как ласковое прозвище. Если же рассматривать второй вариант: корень мог быть связан с казахским словом «жанке» (жадный, алчный) — тогда фамилия пошла бы от прозвища, данного человеку с соответствующим характером. В пользу первой версии говорит распространённость личных имён с компонентом «жан» в казахской среде, вторая — редкость и локальность.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к южным регионам Казахстана (Жамбылская, Туркестанская области) и к Оренбуржью, где исторически была высока доля казахского населения, переходившего на русские фамилии при записи в метрики. Сословно носители Жанкеевых — в основном выходцы из казахов-скотоводов, реже из татар-торговцев. В русских губерниях фамилия почти не встречается, что подтверждает её этническую привязку.

Из-за двойного суффикса фамилия выглядит громоздко, но это как раз и есть её уникальная черта: она несёт следы двух культур — тюркского имени и русского способа его оформления, причём оформления с перестраховкой.