Фамилия Жененков — это отчество, прошедшее две ступени словообразования. В её основе лежит народная форма Женя — сокращение от крестильного имени Евгений (в переводе с греческого — «благородный»). Покровителем этого имени считается священномученик Евгений, который вместе с Василием, Ефремом и другими мучениками проповедовал христианство в Северном Причерноморье.

Сначала от имени Женя образовали украинский патроним Жененко. Суффикс -енко в украинской традиции означал «маленький», «сын»: Жененко — сын Жени. Затем, когда носители этой фамилии оказались в русской языковой среде, к ней добавили русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность. Получилась цепочка: Женя → Жененко (сын) → Жененков (внук). Фактически это отчество второго порядка, где Жененков — сын Жененко и внук Жени.

Такая модель — украинская основа на -енко с последующим присоединением русского -ов — встречается довольно часто в фамилиях, которые фиксировались в пограничных регионах или в среде переселенцев. Она показывает, как оседали и русифицировались фамилии, принесённые с Украины в XVII–XIX веках.

О точном месте и времени возникновения фамилии Жененков говорить сложно — процесс формирования фамилий был длительным. Но её словообразовательная цепочка надёжно указывает на смешанную русско-украинскую языковую среду, где имя Женя было распространённым, а патронимы сначала оформлялись по южнорусскому образцу, а затем адаптировались под северный стандарт.