Фамилия Жежеров — это русский вариант, образованный от украинской или белорусской основы. Её исходная форма — Жежеро или Жежера, а в основе лежит прозвище Жежера (также встречается вариант Жежеря). Словообразовательная модель проста: к основе на -а/-я добавили типичный русский суффикс -ов, указав на принадлежность потомку человека с таким прозвищем.

С происхождением самого прозвища не всё однозначно. В современном украинском языке слова «жежера» нет, хотя однокоренные фамилии встречаются преимущественно на Украине. Первая версия выводит прозвище из искажённого литовского žiežara — «злюка». Если это так, то Жежерой называли человека с крутым, неуживчивым характером. Вторая версия опирается на диалектное украинское слово «жежель» — «место, открытое для ветра», то есть продуваемое, голое возвышение. Тогда прозвище получил тот, кто жил на таком открытом пространстве или, возможно, сам был «продуваемым», легкомысленным.

Обе гипотезы имеют право на существование, но первая — литовская — выглядит правдоподобнее, учитывая, что прозвища по характеру встречаются гораздо чаще, чем топографические, и что на западе Украины, откуда, скорее всего, пошла фамилия, литовское влияние исторически ощутимо.

В документах фамилия фиксируется с XX века. В Книге памяти есть запись о Жежерове Михаиле Васильевиче, 1903 года рождения, уроженце Кустаная, пропавшем без вести в 1941 году. Это показывает, что фамилия встречалась не только на Украине, но и в североказахстанских степях, куда её могли принести переселенцы.