Фамилия Жилинков образована от прозвища Жилинко, в основе которого, вероятно, лежит нарицательное «жила». Слово «жила» имеет несколько значений: «бережливый человек, накопитель», «упрямец, спорщик», «пристрастный человек». Однако прозвище Жилинко могло быть образовано и от прилагательных «жилявый», «жилистый». В таком случае Жилинко могли называть сильного мужчину. Возможно также, что прозвище Жилинко связано с диалектным глаголом «жилять», то есть «язвить, колоть, жалить». Кроме того, нельзя исключать этимологической связи прозвища Жилинко с глаголом «жить». Веселовского записаны однокоренные фамилии: князь Иван Иванович Жила Лыков, первая половина XVI век; Булгак Захарьевич Жилин, 1578 год, Кашира. Так и прозвище Жилинко закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Жилинков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Жилинко, со временем получил фамилию Жилинков.