Фамилия Жишко образована по модели, типичной для украинских, белорусских и южнорусских фамилий: основа плюс уменьшительно-ласкательный суффикс -к- и окончание -о. В данном случае в основе лежит прозвище Жишко, напрямую связанное с нарицательным «жишка» или «жичка» — так в южных и западных говорах называли поросенка, свинку. Слово это того же корня, что и «жир»: домашняя свинья ассоциировалась прежде всего с салом и упитанностью.

Следовательно, прозвище Жишко мог получить человек, который разводил свиней или пас их — свинопас. В крестьянском быту такое занятие было обычным, но прозвище закреплялось за тем, для кого уход за свиньями был главным делом, а не случайным подспорьем. Впрочем, не исключён и более простой вариант: прозвище могли дать ребёнку или невысокому полному человеку в шутку — по аналогии с поросёнком.

Фамилия Жишко почти не встречается в центральных и северных областях России, её ареал — западные регионы: современная Украина, Беларусь, а также Брянская, Смоленская и Курская области. В польском языке есть однокоренное слово «żysko» (свиной корм), что указывает на общеславянскую основу прозвища.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще получали крестьяне и мещане центральной России, фамилия на -ко характерна для казачьих и мещанских родов юго-запада. Если предок носителя фамилии был запорожским казаком или жителем Гетманщины, прозвище Жишко могло закрепиться как фамилия уже в XVII–XVIII веках, когда на этих территориях шло массовое оформление родовых имён.

Споров у этимологии этой фамилии почти нет: все исследователи сходятся на «свином» корне. Альтернативная версия, связывающая фамилию с литовским «žyškas» (бойкий, резвый), выглядит натянутой — слишком далека география и фонетика. Куда вероятнее, что предок нынешних Жишко просто пас свиней или держал свинарник, а прозвище со временем стало родовым именем.