Фамилия Жижков — редкий случай, когда географическое название и прозвище могли сработать одновременно. Проще всего объяснить её через топоним: город Жижков — исторический район Праги. Если предки носителя фамилии были выходцами оттуда (чехи, словаки или русские, долго жившие в тех краях), то Жижковым могли прозвать человека по месту жительства. Но в русской среде чаще срабатывала другая модель — от прозвища Жижок.

Основа «жиж-» в русских говорах имела два значения. Первое — «жижа», то есть нечто жидкое, размякшее, грязное. Второе — диалектное «жиж» или «жижка», что означало «остатки, выжимки, отходы» (например, после варки пива или перегонки дёгтя). Человек, получивший прозвище Жижок, мог иметь отношение к производству напитков или к ремеслу, связанному с переработкой сырья, — либо же просто быть неряшливым, «жидким» в поведении. Суффикс -ов указывает на принадлежность: сын Жижка, потомок Жижка.

Стоит отметить, что фамилия Жижков — не массовая, а довольно редкая. Встречается в основном в центральных и южных областях России, единично — у донских казаков. В отличие от распространённых Жижиных или Жигаловых, Жижков сохранил твёрдый звук в основе, что говорит о более поздней или локальной фиксации фамилии. Спорным остаётся вариант, что корень мог быть заимствован из польского или украинского «жижка» — «желудок» (как прозвище толстого человека), но эта версия менее подтверждена для русских говоров.

Таким образом, предок носителя фамилии Жижков, скорее всего, либо жил в местности, связанной с чешским Жижковом (что маловероятно для крестьянской среды), либо занимался ремеслом, где оставались «жижки» — отходы, выжимки. В любом случае, фамилия недвусмысленно указывает на конкретное прозвище, а не на отчество от церковного имени.