Фамилия Жмыков — твёрдый и редкий случай в русской ономастике. Её основа не связана с крестильным именем или названием профессии, а восходит к прозвищу, которое давали по характерному поведению или особенностям речи.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Жмыка). Значит, в основе лежит прозвище Жмык. В русских говорах слово «жмык» имело несколько значений. В южных и западных диалектах так называли скупого или прижимистого человека, того, кто «жмётся» при расходах. В вятских и пермских говорах «жмык» — это человек, который говорит невнятно, сквозь зубы, «жмыкает». Третье значение, зафиксированное в словаре Даля, — «жмык» как однократное сжатие, удар кулаком или щипок, но прозвище в этом смысле давали скорее драчуну.

Наиболее правдоподобна первая версия: прозвище Жмык закрепилось за человеком бережливым до крайности или за тем, кто постоянно жался, недоедал, копил. В крестьянской среде такое качество не считалось пороком, но выделяло человека среди соседей. Второй вариант — по манере речи — тоже возможен, но встречается реже.

Фамилия Жмыков не относится к дворянским или купеческим. Скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в центральной России или на юге, где слово «жмык» было в ходу. Встречается она и сегодня, хотя и нечасто — её носители живут в основном в Курской, Воронежской, Ростовской областях, а также на Кубани.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Жмыков стоит в одном ряду с Жмуровым, Жмуриным, Жмудским. Но Жмуров происходит от глагола «жмурить» (щуриться), а Жмыков — от иной основы, что подтверждает самостоятельность этого прозвищного гнезда. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» такая модель разбирается на примере прозвищ от глагольных корней, но сам Жмыков не упомянут — фамилия редкая, не попавшая в классические списки.