Фамилия Жукаркина — женская форма, а её мужской вариант — Жукаркин. В основе лежит прозвище Жукарка. Слово это скорее всего образовано от просторечного глагола «жукать». В русских говорах «жукать» означало «пугать, давать нагоняй, бранить, журить, а иногда и бить». Человек, получивший такое прозвище, вероятно, был сварливым, вздорным или слишком строгим — тем, кто постоянно «жукал» домашних.

Обращает на себя внимание суффикс -к(а). В русской антропонимии он часто придаёт прозвищу оттенок фамильярности или уменьшительности, но при этом не делает его ласкательным. Скорее, это характерный признак: Жукарка — не просто «тот, кто жукает», а человек, которого так окрестили за постоянную привычку ворчать или распекать. Такие прозвища часто закреплялись за людьми с неуживчивым нравом в крестьянской среде, где меткое слово быстро становилось семейным именем.

Менее вероятная версия возводит основу к киргизскому слову «жукар» — «становиться тонким (о слое)». Эта гипотеза слабая, потому что фамилия с таким корнем почти не встречается в регионах Средней Азии, а суффикс -к(а) для тюркских заимствований в русских прозвищах нетипичен. Правдоподобнее держаться славянского корня.

Фамилия Жукаркина — редкая. В современных справочниках она не упоминается среди массовых, а значит, её носители, скорее всего, происходят из одной локальной группы. Географически следы фамилии тянутся к южнорусским областям — там глагол «жукать» фиксируется в диалектных словарях. Таким образом, предок Жукаркиных был человеком крутого нрава, которого в деревне прозвали за строгость, и это прозвище пережило века в виде фамилии.