Фамилия Жукаркины — редкий пример русской фамилии, образованной от глагола со значением «пугать» или «бранить». Её основа — просторечное «жукать», то есть «шугать, давать нагоняй, журить, бить». От этого глагола через суффикс -к- (типичный для прозвищ, ср. Журка от журить) появилось прозвище Жукарка. Так могли назвать сварливого, вздорного человека или того, кто любил распекать домашних. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — сын Жукарки, то есть Жукаркин. Со временем фамилия закрепилась за потомками в форме множественного числа — Жукаркины, как это часто бывает у крестьянских и мещанских родов (ср. Кузнецовы, Смирновы).

Менее вероятна версия, связывающая прозвище с киргизским словом «жукар» («становиться тонким»). Она слабо обоснована географически: фамилия Жукаркины встречается в центральных и северных областях России, а не в зоне контакта с тюркскими языками. Скорее всего, перед нами чисто славянская модель, где корень «жук-» (ср. «жучить», «журить») звукоподражательно передаёт действие — «издавать резкий звук, ворчать».

О точном месте возникновения фамилии говорить сложно: процесс становления фамилий у крестьян шёл до XIX века, и Жукаркины могли появиться независимо в нескольких сёлах. Тем не менее это живой пример того, как бытовое прозвище, данное за характер, превратилось в родовое имя.