Фамилия Жумигина — женская форма, мужской вариант — Жумигин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Жумига, а в нём, скорее всего, слышен отголосок древнего тюркского слова «жуму» или «жум» — «собирать, сжимать». В татарском и башкирском языках «жыйым» (йыйым) означает «сбор, сходка», а «жыйыу» — «собирать». Человек по прозвищу Жумига мог быть сборщиком податей, старостой, который собирал людей на сход, или просто бережливым хозяином, «собирателем» добра.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Жумигин — сын Жумиги, то есть из рода того самого человека. Модель образования типична для русских фамилий северных и восточных территорий, где активно шло смешение с тюркским населением. Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий она не встречается, что говорит о её узколокальном происхождении — скорее всего, из районов Поволжья, Приуралья или Западной Сибири, где татаро-башкирский след в ономастике обычен.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным русским глаголом «жмукать» (жать, давить). В таком случае Жумига — прозвище человека, занятого отжимом чего-либо (например, масла или сыра), либо того, кто ходил сжавшись, «жмущегося». Но тюркская этимология выглядит убедительнее из-за характерного звучания основы: сочетание «жу» в русских прозвищах встречается редко и почти всегда заимствовано.

В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется в единичных случаях, преимущественно у крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не известно. Носительницы фамилии Жумигина, скорее всего, происходят из семей, где предок носил тюркское прозвище и обрусел, перейдя в православие.