Фамилия Жумыгин — редкая и неоднозначная по происхождению. Скорее всего, её основа — прозвище Жумыга, которое связывают с украинским глаголом «жумрати» — «жевать». В таком случае прозвище могли дать человеку, который любил плотно и часто поесть, или тому, кто медленно, со вкусом пережёвывал пищу. Это бытовая, понятная модель: на Руси и в Малороссии многие фамилии образованы от прозвищ, указывающих на привычки в еде (сравните: Жевакин, Жуйко, Обжоркин). Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Жумыг- прибавлен суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Жумыги). Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а/-я, поэтому форма Жумыгин закономерна.

Существует и менее вероятная версия — от киргизского слова «жума» (пятница, неделя). По этой логике, Жумыга могло быть прозвищем человека, родившегося или крещённого в пятницу, либо связанного с этим днём по роду занятий. Однако против этой версии говорит несколько фактов. Во-первых, фамилия Жумыгин фиксируется в исторических документах преимущественно в русских и украинских губерниях, а не в Средней Азии. Во-вторых, тюркские основы в русских фамилиях обычно адаптируются иначе: они редко образуют прозвища на -а с последующим суффиксом -ин, если только не проходят через стадию прозвища в русской среде. В-третьих, для киргизского слова «жума» более естественным было бы образование фамилии типа Жумаев или Жумабаев, а не Жумыгин. Поэтому украинская версия выглядит правдоподобнее.

В любом случае, фамилия Жумыгин — пример того, как обычное бытовое прозвище, данное по черте характера или привычке, закрепилось в роду и дошло до наших дней. Потомок человека по прозвищу Жумыга со временем стал Жумыгиным.