Фамилия Журавишкин — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищное происхождение. Основа здесь не от «журавля» (журавель, журавль), а от топонима Журавишки — названия нескольких деревень и хуторов, которые встречаются в исторических документах Витебской, Виленской и Минской губерний (территория современной Беларуси и Литвы). Формант -ишки — типичный для балтийского и западнорусского ономастикона уменьшительный или собирательный суффикс: Журавишки — это буквально «маленькие журавли» или «место, где водятся журавли», но в роли названия поселения.

Модель образования фамилии прозрачна: от названия деревни Журавишки через суффикс -ин, который в русской фамильной системе указывает на принадлежность. Журавишкин — «тот, кто родом из Журавишек». Такой способ типичен для фамилий, возникших в XIX веке, когда крестьянам приписывали фамилии по месту жительства или приписки. Суффикс -ин здесь работает так же, как в фамилиях Москвин, Тверитин, Калугин, только основа — не город, а небольшая деревня.

Если же допустить прозвищную версию, то исходным словом могло быть «журавишка» — ироничное или уменьшительное от «журавль», то есть долговязый человек с длинными ногами. Но против этого говорит редкость такой модели: прозвища на -ишка (вроде Воришка, Голышишка) в русской традиции почти не становились основами фамилий, а если и становились, то обычно с суффиксом -ев или -ов (Воришков), а не -ин. Кроме того, для фамилии на -ин с прозвищной основой нужно было бы имя на -а/-я: Журавишка, что маловероятно.

В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках носители фамилии Журавишкин встречаются почти исключительно среди крестьян и мещан западных губерний — Виленской, Ковенской, Гродненской. Это подтверждает версию о выходцах из одноимённых деревень. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано: в «Общем гербовнике» и списках столбового дворянства она отсутствует.

Сегодня фамилия остаётся редкой, но не исчезнувшей. Её носители живут в основном в России (особенно в Санкт-Петербурге и Москве) и в Беларуси. При этом ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Журави́шкин, что соответствует ударению в исходном топониме (Журави́шки).