Фамилия Жургунов образована от прозвища или имени Жургун по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ов, указывающим на принадлежность («чей?» — сын Жургуна). Основа фамилии редкая, и ее происхождение вызывает споры. Наиболее правдоподобная версия связывает слово «жургун» с тюркскими языками, где корень жур- может означать «бежать», «спешить» или «течь» (ср. казахское жүгіру — «бег»). В таком случае Жургун — прозвище быстрого, подвижного человека, бегуна или гонца. В некоторых тюркских диалектах это слово могло обозначать родник или быстрый ручей, что тоже могло стать основой для прозвища.

Менее вероятна, но возможна версия о связи с калмыцким языком, где есть слово «зурһан» (шесть) — тогда прозвище могли дать шестому ребенку в семье. Однако фонетически это расхождение существенно: переход «з» в «ж» и конечное «н» вместо «һан» нехарактерны для русской адаптации. Поэтому тюркская версия с корнем «бежать» выглядит убедительнее.

Географически фамилия Жургунов тяготеет к регионам с тюркским населением: встречается в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области, а также среди казахов. Это говорит о том, что предки носителя фамилии, скорее всего, были тюрками по происхождению, принявшими русскую фамильную модель. В сословном плане Жургуновы могли быть как крестьянами, так и казаками — в среде оренбургского и уральского казачества фамилии тюркского корня не редкость.

Интересная деталь: фамилия сохранила редкий для русского уха звуковой облик — сочетание «жур» почти не встречается в исконно русских словах (кроме заимствований вроде «журнал»). Это делает Жургунова заметным маркером межэтнического контакта: русский суффикс -ов «прирос» к тюркской основе, и получилась фамилия, которая звучит по-русски, но корнями уходит в степь. Если сравнивать с однокоренными, то в русских архивах встречаются Жургуновы, Журкины (от Журка — уменьшительное от Жургун) и совсем редкие Жургуновские — вариант с польским суффиксом, указывающий на шляхетское происхождение отдельных ветвей.