Фамилия Жусупбаев образована от мужского тюркского имени Жусупбай. Первая из них ведет свое начало от имени Жусуп, казахского варианта древнееврейско-арабского имени Юсуп – «получивший прибавку, дополнительные блага от Аллаха, дополнительно возвышенный Аллахом», «обладатель красоты, красавец». Вторая часть восходит к древнетюркскому «бай» - «богатый, могущественный хозяин, господин, повелитель». Таким образом, потомок человека, которого звали Жусупбай, со временем получил фамилию Жусупбаев.