Фамилия Жусупова образована от мужского имени Жусуп, которое представляет собой одну из тюркских адаптаций библейского имени Иосиф. В арабской традиции это имя звучит как Юсуф, а в казахском и других тюркских языках закрепилась форма Жусуп. Исходное древнееврейское имя Йосеф переводится как «Бог приумножит» или «божья награда» — в разных толкованиях смысл сводится к идее дара, прибавления, вознаграждения свыше. Чаще всего так называли долгожданного, вымоленного ребенка.

Словообразовательная модель фамилии типична для казахской и киргизской антропонимии: к основе Жусуп добавляется суффикс -ов(а), который в данном случае выполняет функцию притяжательности и указывает на принадлежность роду. Буквально Жусупова означает «дочь/потомок Жусупа». Такая модель сложилась под влиянием русской патронимической традиции, когда в XIX–XX веках фиксировались фамилии тюркских народов по отцовскому имени с окончанием -ов/-ев или -ин. В самой казахской среде до этого использовались формы отчества без суффикса (Жусупұлы — «сын Жусупа», Жусупқызы — «дочь Жусупа»).

Фамилия широко распространена в Казахстане и среди казахской диаспоры. Встречается также в Киргизии, где имя Жусуп может писаться через «у» — Жусуп, хотя в киргизском языке более привычна форма Жусупбек. Реже фамилия фиксируется у татар и башкир, где имя Юсуф дало варианты Юсупов, Юсупова. Жусупова — характерный пример того, как одно и то же имя, пройдя через разные языковые фильтры, порождает различные фамилии: Юсупов, Иосифов, Жусупов, Йосыпов.

Социальный контекст фамилии не привязан к конкретному сословию. В казахской степи имя Жусуп могли носить и рядовые кочевники, и потомки биев (судей), и муллы, получившие образование в медресе. Фамилия не указывает на аристократическое происхождение, но говорит о том, что предок носителя был мусульманином и носил имя, почитаемое в исламе: пророк Юсуф (Иосиф Прекрасный) — один из центральных персонажей Корана, символ красоты, терпения и праведности.