Фамилия Зубаерова — женская форма фамилии Зубаеров, и её разговор с историей стоит начать с ударения и суффикса. В русских фамилиях суффикс -ов/-ев обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Зубаеров. Основа здесь — Зубаер. Это не имя и не очевидное прозвище, что сразу наводит на мысль о тюркском или арабском следе. Фамилия звучит нетипично для центральной России и явно несёт восточный отпечаток.

Скорее всего, в основе лежит тюркское имя или прозвище Зубаер. Оно восходит к арабскому «Зубайр» (уменьшительная форма от «зубр» — «сильный», «мужественный»). Имя Зубайр носил один из сподвижников пророка Мухаммеда, известный своей храбростью. В тюркской среде, особенно у татар и башкир, такие имена адаптировались: звук «й» мог переходить в «е», а конечный «р» оставался. Так Зубайр превращался в Зубаер. Фамилия на -ов/-ев закрепила его в русской паспортной системе.

Альтернативная версия, менее вероятная, — связь с русским словом «зуб» и диалектным «заерзать» (ёрзать, двигаться). Тогда Зубаер могло быть прозвищем человека с крупными или редкими зубами, который постоянно вертелся. Но эта гипотеза слабая: во-первых, суффикс -ер нехарактерен для русских прозвищ (обычно Зубатый, Зубарь), во-вторых, фамилия встречается в Поволжье и на Урале — регионах с сильным татарским влиянием. Поэтому тюркское происхождение гораздо правдоподобнее.

Географически фамилия Зубаерова (и Зубаеров) тяготеет к Башкортостану, Татарстану, Оренбургской и Челябинской областям. Носители — потомки крещёных татар, башкир или мишарей, которые в XVIII–XIX веках получали русские фамилии по отцу. Сословно это могли быть государственные крестьяне или мещане, реже — служилые люди. Дворянских корней у фамилии нет: в родословных книгах она не значится.

Написание с буквой «ё» (Зубаёрова) встречается, но редко и обычно — результат ошибки в паспорте или переписи. Правильная форма — через «е», с ударением на второй слог: Зуба́ерова. В быту фамилию иногда путают с Зубаревой, но это разные основы: Зубарев — от «зубарь» (человек с зубами), а Зубаеров — от имени.