Фамилия Зубайкина — женская форма фамилии Зубайкин. Её основа, в отличие от очевидной ассоциации с зубами, скорее всего, восходит к личному имени или прозвищу, а не к анатомической детали. Разберёмся, как именно она могла появиться.

Словообразовательная модель указывает на суффикс -ин, типичный для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. В основе лежит Зубайка — так в старину могли называть человека. Само имя Зубайка — это уменьшительно-ласкательная или пренебрежительная форма от канонического имени Зуб (Зубей, Зубко). В древнерусских документах имя Зуб встречается нередко: так, в новгородских берестяных грамотах упоминается некий Зуб, а в XV–XVI веках фиксируются Зубатые, Зубовы — все они ведут род от прозвища, данного за крепкие, редкие или, наоборот, отсутствующие зубы. Однако есть и другая версия.

В некоторых говорах «зубайка» могло означать не человека, а предмет — например, зубатую рыбу (щуку) или даже вид речного судна с выступающим носом. Но более вероятно, что фамилия образована от мирского имени Зубай, которое давали ребёнку в качестве оберега: считалось, что имя с «острым» значением отпугивает злых духов. Суффикс -к- (Зубайка) здесь уменьшительный, как в Ванька или Митька, то есть фамилия буквально значит «сын (или дочь) Зубайки». Географически фамилия Зубайкины встречается преимущественно в Поволжье и центральных областях России, что косвенно подтверждает её русское, а не иноязычное происхождение.

Таким образом, предок носительницы фамилии Зубайкина — человек, которого в округе знали под именем Зубайка. Кем он был — крестьянином, ремесленником или служилым человеком — сказать сложно, но сама фамилия относится к древнему пласту русских прозвищных фамилий, где за обыденным звучанием скрывается языческая традиция называть детей «острыми» именами для защиты.