Фамилия Зубаркина — женская форма фамилии Зубаркин. Её основа и способ образования не так очевидны, как у фамилий на -ов или -ин, и здесь есть пространство для версий.

Словообразовательная модель: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Зубаркин, то есть сын или потомок Зубарки). А вот корень «зубарк-» — явно производное. Скорее всего, в основе лежит прозвище или профессиональное имя Зубарь. В русских говорах «зубарь» — это не только тот, у кого крепкие зубы, но и человек, умеющий грызть, отстаивать своё, упрямый. В некоторых регионах так называли резчика по кости или зубу (например, мастеров, делавших гребни и пуговицы из моржового клыка). От «Зубарь» через уменьшительную или пренебрежительную форму «Зубарка» (аналогично: пахарь — пахарка, но здесь как прозвище для человека) и родилась фамилия.

Менее вероятная, но допустимая версия: связь с украинским или белорусским словом «зубар» (зубр). В таком случае фамилия могла указывать на силу, дикость или даже место обитания (например, лес, где водились зубры). Однако суффикс -к- в основе (Зубар-к-ин) чаще встречается именно в русских прозвищных фамилиях, а не в «животных» топонимах.

Географически фамилия Зубаркин (и Зубаркина) тяготеет к центральным и южнорусским областям, встречается в Тамбовской, Воронежской, Рязанской губерниях. Это говорит о том, что предки были скорее всего крестьянами или ремесленниками, а не дворянами: фамилии на -ин с прозвищной основой в этой среде — обычное дело.

В справочниках по ономастике (например, в работах Б. Унбегауна) подобные модели описаны как типичные для «бытовых» прозвищ, которые давались по характеру или занятию. Так что Зубаркины — потомки человека, которого в округе знали как Зубаря: либо за его упрямство и цепкость, либо за работу с костью и зубом. Точного ответа, какой именно смысл вкладывали соседи, уже не найти, но оба варианта рисуют образ человека неспокойного и мастеровитого.