Фамилия Зубарев образована от прозвища Зубарь. В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского зафиксирован Михил Иванович Зубарь Константинов, живший во второй половине XV века, и Зубака Федор Микулин, крестьянин 1564 года из Олонца. Прозвище Зубарь, скорее всего, указывало на человека с заметными, крупными или редкими зубами, а иногда — на мастера, который вставлял зубы или занимался зуботычинами в переносном смысле (драчуна). Фамилию закрепили по модели «чей?» — Зубарев, то есть сын или потомок Зубаря. Интересна деталь: в тех же источниках упоминается Михил Иванович Зуб Константинов, что говорит о параллельном бытовании прозвища Зуб и производного Зубарь. Потомки человека с прозвищем Зуб тоже могли стать Зубаревыми, но основная версия — от Зубаря. Фамилия нередкая для северных и центральных областей России, где прозвища по физическим признакам давали особенно часто.