Фамилия Зуборев — одна из тех, что прямо указывает на прозвище предка. Основа здесь — слово «зуборь». В старину так могли назвать человека с крепкими, крупными или редкими зубами, либо того, кто часто скалился, огрызался — словом, имел заметную «зубастую» черту характера или внешности. Суффикс -ев в фамилии типичен для русских отчеств, образованных от основ на мягкий согласный или -ь: Зуборь → сын Зуборя → Зуборев.

Имя Зуборь не было редкостью в допетровской Руси. В исторических документах, собранных ономатологом С. Б. Веселовским, встречается Михил Иванович Зуборь Константинов, живший во второй половине XV века. Там же упомянут крестьянин Зубака Федор Микулин (1564 год, Олонец) — это однокоренное прозвище от той же основы «зуб», но с другим суффиксом. Такие варианты показывают, что прозвища от «зубов» были в ходу в разных говорах и регионах.

Географически фамилия Зуборев, скорее всего, закрепилась в северных и центральных областях России, где встречаются ранние упоминания однокоренных прозвищ. В отличие от более распространённой Зубова, форма с суффиксом -орь (-арь) встречается реже и звучит архаичнее. Человек по прозвищу Зуборь мог быть крестьянином или посадским — сословной привязки у этой фамилии нет, её носили разные слои населения. Главное, что потомки сохранили память о предке, которого за что-то прозвали Зуборём, и это прозвище стало их родовым именем.