Фамилия Абалгмов — редкий пример, где написание расходится с произношением и затемняет корень. На слух фамилия звучит как «Абалгамов», и именно так её чаще всего и записывали в документах. Вариант через «о» — Абалгмов — возник, скорее всего, из-за окающего говора (когда «а» в безударном положении произносят как «о») или из-за случайной описки, которая закрепилась. Поэтому логичнее всего разбирать эту фамилию как Абалгамов.

В основе лежит тюркское мужское имя Абалгам. Оно составное: первая часть «абал» (или «абул») восходит к арабскому «абу» — «отец», «обладатель». Вторая часть — «гам» — от арабского же «гаммам» или «хаммам», что значит «баня», но в переносном смысле — «теплота», «забота». В целом имя Абалгам можно истолковать как «отец тепла» или «заботливый». Такие составные имена с компонентом «абу» были распространены у народов, принявших ислам, особенно у татар и башкир.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Абалгам добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын Абалгама», «принадлежащий Абалгаму». Таким образом, предок носителя современной фамилии, скорее всего, был человеком по имени Абалгам — татарином или башкиром, жившим в среде, где фамилии давали по имени отца.

Географически фамилия Абалгамов (и её редкий вариант Абалгмов) привязана к Поволжью и Приуралью — регионам традиционного расселения татар и башкир. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении, возможно, от одного родового корня в конкретной деревне. Социального статуса фамилия не раскрывает: её мог носить и крестьянин, и купец, и мулла — единственное, что объединяет всех первых носителей, это происхождение от человека по имени Абалгам.